Công ty đã nhiều lần gửi đơn kiến nghị đến các cơ quan có thẩm quyền tại địa phương và chủ đầu tư nhưng không được giải quyết. Qua Cổng TTĐT Chính phủ, Công ty tiếp tục gửi đơn đến Thủ tướng Chính phủ đề nghị được xem xét, có biện pháp giải quyết tình trạng này.
Về vấn đề này, UBND tỉnh Yên Bái có ý kiến như sau:
Ngay sau khi nhận được phản ánh của Công ty TNHH Yên Phú gửi qua Cổng TTĐT Chính phủ, UBND tỉnh Yên Bái đã chỉ đạo các cơ quan, đơn vị có liên quan tiến hành kiểm tra, rà soát, đánh giá những ảnh hưởng của dự án cải tạo, nâng cấp đường cảng Hương Lý - ga Văn Phú, đề xuất phương án xử lý các vướng mắc phát sinh do ảnh hưởng của dự án đối với các hộ dân, tổ chức dọc tuyến đường thi công, đặc biệt là đối với khu vực nhà xưởng của Công ty TNHH Yên Phú.
Trên cơ sở nội dung báo cáo và kiến nghị của Sở Giao thông vận tải, báo cáo giám sát của Công ty Phát triển và Kinh doanh hạ tầng các Khu công nghiệp (chủ đầu tư); báo cáo giám sát của Sở Kế hoạch và Đầu tư về việc thực hiện dự án đầu tư xây dựng công trình cải tạo nâng cấp đường cảng Hương Lý - ga Văn Phú (đoạn Quốc lộ 70 - ga Văn Phú), UBND tỉnh Yên Bái đã có văn bản đồng ý cho phép điều chỉnh, bổ sung một số hạng mục mang tính chất xử lý kỹ thuật, bước thiết kế bản vẽ thi công, trong đó nghiên cứu phương án xử lý hiện tượng ngập úng cục bộ tại một số vị trí nhà dân và tổ chức hai bên tuyến đường bị ảnh hưởng trên cơ sở không làm vượt tổng mức đầu tư của dự án đã phê duyệt.