Về vấn đề này, Cục Thuế TP. Hà Nội có ý kiến như sau:
Căn cứ Thông tư số 95/2016/TT-BTC ngày 28/6/2016 của Bộ Tài chính hướng dẫn về đăng ký thuế:
Tại Khoản 1, Điều 2 quy định về đối tượng áp dụng: “1. Người nộp thuế là các doanh nghiệp, tổ chức, cá nhân sau:
... d) Tổ chức được thành lập bởi cơ quan có thẩm quyền không có hoạt động sản xuất, kinh doanh nhưng phát sinh nghĩa vụ với ngân sách Nhà nước (sau đây gọi là Tổ chức khác)”.
Tại Điều 6 quy định về thời hạn nộp hồ sơ thuế: “Người nộp thuế có trách nhiệm thực hiện đăng ký thuế theo đúng thời hạn quy định tại Điều 22 Luật Quản lý thuế, cụ thể như sau:
1. Các tổ chức kinh tế, tổ chức khác có hoạt động sản xuất kinh doanh phải thực hiện đăng ký thuế trong thời hạn 10 (mười) ngày làm việc, kể từ:
... - Ngày phát sinh trách nhiệm khấu trừ và nộp thuế thay cho nhà thầu, nhà thầu phụ nước ngoài; tổ chức nộp thay cho cá nhân theo hợp đồng, văn bản hợp tác kinh doanh...
2. Tổ chức, cá nhân không hoạt động sản xuất kinh doanh có phát sinh nghĩa vụ nộp ngân sách Nhà nước hoặc được hoàn thuế thực hiện đăng ký thuế cùng với thời hạn nộp hồ sơ khai thuế hoặc thời hạn nộp hồ sơ hoàn thuế lần đầu theo quy định của Luật Quản lý thuế”.
Tại Khoản 1, Khoản 6, Điều 7 quy định về hồ sơ đăng ký thuế: “1. Hồ sơ đăng ký thuế đối với người nộp thuế là tổ chức kinh tế, tổ chức khác quy định tại Điểm b, Điểm c, Khoản 1, Điều 2 Thông tư này
a) Đối với đơn vị độc lập, đơn vị chủ quản, hồ sơ đăng ký thuế gồm:
- Tờ khai đăng ký thuế mẫu số 01-ĐK-TCT và các bảng kê (nếu có) ban hành kèm theo Thông tư này;
- Bản sao không yêu cầu chứng thực Giấy phép thành lập và hoạt động, hoặc Quyết định thành lập, hoặc Giấy phép tương đương do cơ quan có thẩm quyền cấp, hoặc Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh theo quy định của pháp luật của nước có chung biên giới (đối với tổ chức của nước có chung biên giới đất liền với Việt Nam thực hiện hoạt động mua, bán, trao đổi hàng hóa tại chợ biên giới, chợ cửa khẩu, chợ trong khu kinh tế cửa khẩu của Việt Nam).
... 6. Đối với người nộp thuế là tổ chức, cá nhân không phát sinh nghĩa vụ nộp thuế nhưng được hoàn thuế (trừ cơ quan đại diện ngoại giao, cơ quan lãnh sự và cơ quan đại diện của tổ chức quốc tế tại Việt Nam) quy định tại Điểm đ, Khoản 1, Điều 2 và các tổ chức không hoạt động sản xuất, kinh doanh nhưng phát sinh nghĩa vụ thuế theo quy định tại Điểm d, Khoản 1, Điều 2 Thông tư này, hồ sơ đăng ký thuế gồm:
Tờ khai đăng ký thuế mẫu số 01-ĐK-TCT ban hành kèm theo Thông tư này, trong đó người nộp thuế chỉ khai các chỉ tiêu: 1, 2, 3, 4, 9, 10, 12, 14, 15”.
Tại Điều 8 quy định về địa điểm nộp hồ sơ đăng ký thuế: “Địa điểm nộp hồ sơ đăng ký thuế thực hiện theo quy định tại Điều 24 Luật Quản lý thuế, cụ thể:
... 3. Tổ chức khác nộp hồ sơ đăng ký thuế tại:
a) Cục Thuế nơi tổ chức đóng trụ sở đối với tổ chức do cơ quan trung ương và cơ quan cấp tỉnh ra quyết định thành lập”.
Căn cứ quy định nêu trên, trường hợp Ban quản lý dự án sử dụng viện trợ phi chính phủ, không phải tổ chức kinh doanh, không phát sinh doanh thu, nhưng có phát sinh nghĩa vụ với ngân sách Nhà nước (nộp thuế hoặc hoàn thuế) thì phải đăng ký thuế, hồ sơ thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 7 Thông tư số 95/2016/TT-BTC của Bộ Tài chính.
Địa điểm nộp hồ sơ thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 8 Thông tư số 95/2016/TT-BTC nêu trên.
Về khai thuế thu nhập cá nhân (nếu phát sinh trách nhiệm khấu trừ thuế thu nhập cá nhân) thực hiện theo Điều 16 Thông tư số 156/2013/TT-BTC, sửa đổi, bổ sung tại Điều 21 Thông tư số 92/2015/TT-BTC.
Về hoàn thuế giá trị gia tăng (nếu sử dụng nguồn vốn viện trợ phi chính phủ để mua hàng hóa, dịch vụ tại Việt Nam để phục vụ dự án được cấp có thẩm quyền phê duyệt) thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 51 Thông tư số 156/2013/TT-BTC.
Trường hợp không phát sinh nghĩa vụ với ngân sách Nhà nước thì không phải đăng ký thuế.
Nếu còn vướng mắc, đề nghị bà liên hệ với cơ quan thuế quản lý trực tiếp để được hướng dẫn cụ thể.