Căn cứ quy định tại Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật thuế TNDN số 32/2013/QH13 ngày 19/6/2013; Luật số 71/2014/QH13 sửa đổi, bổ sung một số điều của các Luật thuế; Nghị định số 218/2013/NĐ-CP ngày 26/12/2013 của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật thuế TNDN; Nghị định số 12/2015/NĐ-CP ngày 12/2/2015 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của các Luật về thuế và sửa đổi, bổ sung một số điều của các Nghị định về thuế, quy định thu nhập miễn thuế bao gồm:
Thu nhập từ trồng trọt, chăn nuôi, nuôi trồng, chế biến nông sản, thủy sản, sản xuất muối của hợp tác xã; thu nhập của hợp tác xã hoạt động trong lĩnh vực nông nghiệp, lâm nghiệp, ngư nghiệp, diêm nghiệp thực hiện ở địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội khó khăn hoặc địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn; thu nhập của doanh nghiệp từ trồng trọt, chăn nuôi, nuôi trồng, chế biến nông sản, thủy sản ở địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn; thu nhập từ hoạt động đánh bắt hải sản.
Về việc xác định ưu đãi thuế TNDN đối với thu nhập từ thanh lý cây cao su: Căn cứ ý kiến của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tại công văn số 4478/BNN-ĐMDN ngày 17/12/2013: “Đối với khoản thu nhập khác từ việc thanh lý tài sản, bán phế liệu phế phẩm liên quan đến các sản phẩm trồng trọt …: thống nhất quan điểm được coi là thu nhập miễn thuế, trừ thu nhập từ việc thanh lý cây cao su đã khai thác hết thời gian lấy mủ vẫn cần được tính thuế. Vì sản phẩm này hiện là nguyên liệu có giá trị cho sản xuất các sản phẩm đồ gỗ và có thể coi đây là sản phẩm có giá trị thu nhập đối với trồng trọt cao su.”. Trên cơ sở ý kiến của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư về thuế TNDN hướng dẫn không áp dụng miễn thuế TNDN đối với thu nhập từ thanh lý vườn cây cao su.
Liên quan đến kiến nghị miễn thuế TNDN đối với thu nhập từ thanh lý cây cao su của Hiệp hội cao su Việt Nam, Tổng cục Thuế có nhận được công văn số 172/HHCS ngày 16/6/2016 của Hiệp hội cao su Việt Nam và công văn số 144/HĐTVCSVN-KHĐT ngày 25/3/2016 của Tập đoàn Công nghiệp cao su Việt Nam kiến nghị về việc ưu đãi thuế TNDN đối với hoạt động thanh lý cây cao su. Sau khi nhận được ý kiến của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tại công văn số 6479/BNN-QLDN ngày 02/8/2016, Bộ Tư pháp tại công văn số 2353/BTP-PLDSKT ngày 18/7/2016, Bộ Kế hoạch và Đầu tư tại công văn số 6990/BKHĐT-KTNN ngày 31/8/2016, Ủy ban nhân dân các tỉnh liên quan và báo cáo Bộ Tài chính, Tổng cục Thuế đã có công văn số 4176/TCT-DNL ngày 14/9/2016 (đính kèm) gửi Hiệp hội cao su Việt Nam và Tập đoàn Công nghiệp cao su Việt Nam về chính sách thuế TNDN đối với việc thanh lý cây cao su với nội dung tiếp thu và sẽ trình các cấp có thẩm quyền nghiên cứu, sửa đổi quy định về ưu đãi thuế TNDN đối với thu nhập từ thanh lý cây cao su phù hợp với quy định của pháp luật và thực tế hoạt động sản xuất kinh doanh của ngành cao su khi sửa đổi, bổ sung các văn bản quy phạm pháp luật về thuế có liên quan.